从关外入主中原，在许多方面保留了少数民族的习俗，在婚姻方面更是如此，最直接的体现便是，姑侄、姐妹同侍一夫。在儒家伦理纲常看来，这属于乱伦。
统一女真各部落，娶了蒙古科尔沁贝勒明安的女儿为侧妃，开了与蒙古部落联姻的先河。不仅如此，大清、王、贝勒等贵族，不单娶了蒙古部落的女子为妻，他们还把自己的女儿嫁过去，这些混乱的婚姻关系，让皇室家族的血脉变得极其混乱。
帝是近亲结婚，他娶了的两个侄女和一个侄孙女，也就是说，顺治帝不仅娶了两个亲表妹，还娶了自己的表侄女为妻。帝也曾娶过自己的表妹，而且他的后妃中有四对亲姐妹。
这种近亲婚配，说到底都是为了维持皇族利益。政治婚姻为历朝清帝奉行的基本国策，可以说，从孝庄太后到隆裕，近亲婚配的陋习，一直贯穿于整个历史。，这种近亲的婚配，给后来的三代帝王带来了灭顶之灾。
从到再到宣统，整整50年的时间里，皇宫之中再也没有生下一男半女。同治帝于同治十一年举行大婚典礼，死于同治十三年十二月。这两年多时间里，他居然没有留下一儿半女，何况同治皇帝还较为好色。
光绪皇帝死的时候38岁，虽然在政治上难有作为，在婚姻上他还是有很大的自由度的，不会干涉他的私生活。而且，作为一国之君，他起码也有着皇后和众多妃子陪伴，他最宠爱的常伴身边，但膝下无子，确实令人费解。
作为末代皇帝的溥仪，他活了61岁，先后去了四个老婆，但也没有留下后代。
晚清连续三代皇帝都没有留下子嗣，的确让人震惊，这在中国封建历史上是绝无仅有的事。“不孝有三，无后为大”普通百且如此，一个皇帝没有生育能力是会被天下人耻笑的，三朝皇帝个个绝后，是爱新觉罗先祖们种下的恶果，他们近亲婚配和乱伦的行为，使得血脉是纯之又纯了，但却导致了后来大清帝王身体的病变，更是三朝帝王不孕的直接原因。